Hiện nguyên nhân của vụ tai nạn này đang được các ngành chức năng huyện Tuy Phước tiến hành điều tra làm rõ.
Xe mô tô mang biển số 77M9- 9497, do chị Trần Thị Loan (49 tuổi, ở thôn Hưng Nghĩa, xã Phước Nghĩa, huyện Tuy Phước, Bình Định) điều khiển, khi đến đoạn giao nhau giữa đường bộ và đường sắt thì xảy ra tai nạn với đoàn tàu hỏa mang ký hiệu SE2 (gồm: 13 toa xe và đầu máy mang ký hiệu 951 kéo) do lái tàu Trương Trung Huấn ở xí nghiệp đầu máy Sài Gòn điều khiển theo hướng Sài Gòn – Hà Nội.
Một số người dân địa phương cho biết, thời điểm xảy ra vụ tai nạn, đầu máy đoàn tàu đã vượt qua khỏi đường ngang, nhưng không hiểu sao chị Loan vẫn cho xe lao thẳng vào đoàn tàu đang chạy.